基于生物信息学筛选三阴性乳腺癌生物标志物及小分子药物的研究

作者：杨柳; 陈玲玉; 张蕾^*

来源：农垦医学, 2021, 43(05): 385-390.

• 三阴性乳腺癌
• 生物信息学
• 生物标志物
• 小分子治疗药物

目的：确定三阴性乳腺癌（Triple negative breast cancer,TNBC）潜在生物标志物和小分子治疗药物。方法：GSE65212和GSE53752的相关数据来自基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）;clusterProfile软件包用于DEGs基因本体论（Gene Ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）分析；Kaplan-Meier Plotter网站和癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库评估中枢基因的临床价值；基于CMap数据库探索TNBC潜在小分子治疗药物。结果：本研究在GSE65212和GSE53752芯片数据集中共鉴定出888个差异表达基因（Differentially expressed genes,DEGs）;GO分析表明，DEGs与有丝分裂核分裂以及有丝分裂姐妹染色单体分离密切相关；KEGG分析显示，DEGs直接或间接参与了细胞周期，细胞衰老和细胞凋亡等过程；生存分析表明CDCA8,BUB1,AURKB,BUB1B,KIF2C,NCAPG,CCNA2,CCNB2和DLGAP5与患者不良预后相关（P<0.05）;CMap数据库鉴定出3种小分子药物quinostatin,MS-275和apigenin(P<0.05)。结论：本研究获得的9个中枢基因和3种小分子药物可能为TNBC的研究提供新的思路。

• 单位
  石河子大学医学院第一附属医院; 石河子大学