2022年济南市3株输入性新型冠状病毒奥密克戎BQ.1全基因组特征分析

作者：白飒; 刘保华; 闫荣军; 赵辉; 孙连波; 张涛; 韩焕美^*

来源：中国人兽共患病学报, 2023, 39(11): 1060-1064.

• 新型冠状病毒
• 境外输入
• 奥密克戎变异株
• 全基因组测序
• 进化分析

目的 从病毒基因组水平上了解3株济南市同一时期不同来源的输入性新冠病毒(SARS-CoV-2)的全基因组特征和变异情况，为进一步完善口岸新冠肺炎疫情防控工作提供科学依据。方法 选取济南市3例输入性新冠病毒感染者的鼻咽拭子样本，采用二代测序技术进行全基因组测序，通过生物学信息软件进行变异位点和同源性分析。结果 成功从3例无症状感染病例样本中获得SARS-CoV-2全基因组序列，全长在29 835 bp～29 844 bp。Pangolin分型结果显示，3例样本基因型依次为OmicronBQ.1,BQ.1.1,BQ.1.12,与原始毒株相比，分别产生了77、80、78个碱基位点的突变，涉及60～63处非同义突变，主要集中在S和ORF1ab基因上。结论 OmicronBQ.1及其分支为济南口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型，为口岸新冠病毒的溯源及防控提供理论依据。