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摘要
乳酸菌在自然界中广泛存在，具有丰富的物种多样性，在食品、饲料和医药等领域广泛应用，目前市场上绝大多数的益生菌都是乳酸菌。近年来，全基因组测序技术蓬勃发展，大大促进了乳酸菌资源的开发与应用。基于乳酸菌的全基因组信息可以系统且全面地了解菌株的代谢特征、潜在的益生功能与应用方向，可以更加准确地探究乳酸菌的遗传、进化和分类。乳酸菌安全性评价程序要求在基因组水平检索是否存在耐药、毒力和致病性相关基因，并判定相关基因是否可水平转移。应用全基因组测序技术，比较不同代次菌株基因组中基因序列和结构差异，可高效、完整地判定乳酸菌在产业化应用过程中的遗传性和稳定性。在全基因组信息基础上，重构基因组规模代谢网络模型，可模拟并预测菌体细胞在特定环境下的行为，能系统地指导菌株的代谢工程策略。本文对全基因组测序技术在乳酸菌代谢特性、遗传进化、安全性和稳定性方面的应用现状进行了综述，旨在为乳酸菌基因组学研究提供理论支持。
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单位公共卫生学院; 四川大学
