鸭疫里默氏菌贵州分离株OmpA基因的克隆及生物信息学分析

作者：马光强; 刘丽娟; 陈国权; 吴良涛; 杨均; 刘军泽; 李潇蒙; 潘成文; 周碧君^*

来源：动物医学进展, 2022, 43(09): 12-19.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2022.09.024

• 鸭疫里默氏菌
• OmpA基因
• 生物信息学分析

为了解鸭疫里默氏菌(Riemerella anatipestifer,RA)贵州分离株OmpA基因遗传特性和用作基因工程亚单位疫苗开发的可能性，以13株RA贵州分离株(RA-SS-1～12株和RA-AS-1株)为研究对象，用RA OmpA基因特异性引物对13株RA贵州分离株进行PCR扩增，将扩增得到的OmpA基因片段与pMD19-T载体连接，转化大肠埃希氏菌DH5α感受态细胞，经PCR和双酶切鉴定为阳性克隆后进行测序；用生物信息学软件将13株RA贵州分离株与国内外15株参考株OmpA基因序列进行核苷酸同源性分析和遗传进化分析，并对RA OmpA蛋白进行理化性质分析、跨膜结构和信号肽预测、B细胞抗原表位预测、二级和三级结构预测。结果表明，13株RA贵州分离株OmpA基因全长均为1 164 bp,可编码387个氨基酸，株间核苷酸同源性为100%,与参考株GZ-RA8、GZ-RA9、GZ060302、SD-RA2018和Yb2株的同源性达100%”;RA OmpA蛋白属亲水性蛋白，无跨膜和信号肽区域，含有较多的优势抗原表位结构，且OmpA基因高度保守并具有良好的抗原特性，其可作为制备RA基因工程亚单位疫苗的候选蛋白。

• 单位
  贵州大学; 动物科学学院; 黔南民族职业技术学院