深圳市龙华区2019年札如病毒基因分型以及进化分析

作者：郝夏琼; 任燕; 许少坚; 李锦宗; 满云翔; 赖晓玲; 全德甫; 曹赫; 林启辉^*

来源：中国热带医学, 2021, 21(03): 247-250.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2021.03.11

• 札如病毒
• 进化分析
• 基因分型
• 疫情暴发

目的分析2019年深圳市龙华区札如病毒的基因型别,掌握辖区内札如病毒的流行情况。方法采用实时荧光定量PCR对283份龙华区感染性腹泻疫情样本进行轮状病毒、诺如病毒和札如病毒核酸检测,对札如病毒阳性样本核酸采用RT-PCR(反转录–聚合酶链式反应)扩增,并对扩增产物进行序列测定和遗传进化分析。结果 2019年龙华区共发生感染性腹泻聚集性疫情24起,共采集283份样本。其中由诺如病毒引起15起(占62.5%),札如病毒引起4起(占16.6%),札如和诺如病毒共同引起1起(占4.1%),未检测出病原体4起(占16.6%)。283份感染性腹泻疫情样本中,诺如病毒检测阳性率为17.7%(50/283);札如病毒阳性率为8.1%(23/283),轮状病毒未检出,所有病例无混合感染情况。23例札如阳性样本有5例VP1条带扩增成功,扩增效率为21.7%,基因亚型鉴定分析结果表明2株为GII.3型,3株为GII.4型。结论在2019年龙华区腹泻疫情方面,GⅡ.3和GⅡ.4型是札如病毒的主要型别。诺如依然是龙华区感染性腹泻中引起散发和暴发的首要病原体,星状,轮状,腺状仅在散发病例中发现,而札如已成为引起急性腹泻病的重要病原体,应尽快开展龙华区对札如病毒的常规检测和进一步的分子分型工作。

• 单位
  深圳市龙华区疾病预防控制中心