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摘要
为了对猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5蛋白的结构和功能进行探究，本研究对PRRSV当前流行株CHsx1401的GP5蛋白基因进行生物信息学分析。结果显示，CHsx140株GP5蛋白基因全长603 bp，编码200个氨基酸；分子质量为22 152.89 Da，理论等电点为8.276，不稳定性系数为37.54，属于稳定的疏水性蛋白；信号肽预测显示GP5蛋白在第1～31位氨基酸处存在信号肽；亚细胞定位预测GP5蛋白主要分布于内质网；跨膜螺旋结构预测显示GP5蛋白存在2个跨膜螺旋结构域；且其存在30个O-糖基化位点和39个磷酸化位点；抗原性分析显示GP5蛋白柔韧性差，表面可及性区域少，有多个抗原指数较高区域；GP5蛋白二级结构中以α螺旋为主。氨基酸同源性和序列比对结果显示PRRSV CHsx1401株GP5的氨基酸与NADC30株的同源性最高，与HUN4株同源性最低，且CHsx1401株GP5蛋白存在多个氨基酸突变位点；GP5蛋白基因系统进化分析显示CHsx1401株与NADC30株位于同一个分支，遗传距离最近，与QYYZ株遗传距离最远。本研究对PRRSV CHsx1401株GP5蛋白基因进行生物信息学分析，为进一步研究PRRSV GP5蛋白的结构和功能提供参考。
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