基于线粒体Cytb和COI基因的东北红豆杉群体遗传结构研究

作者：**丹^*; 孙丹; 李晓红; 张彦文

来源：分子植物育种, 2023, 1-11.

• 东北红豆杉
• 野生种
• 栽培种
• Cytb基因
• COI基因
• 群体遗传多样性

为比较东北地区红豆杉野生群体与栽培群体的遗传多样性，探究其种质资源情况，本研究基于红豆杉线粒体DNA Cytb和COI基因序列对东北红豆杉1个野生群体(WT)和2个栽培群体，即日本红豆杉(CJ)和韩国红豆杉(CH)群体的遗传结构与遗传多样性等做了比较研究。结果表明：Cytb基因1 170 bp，A+T含量59.40%和(G+C)含量40.60%，Cytb基因1 044 bp，(A+T)含量55.36%和G＋C含量44.64%；Cytb和COI基因在90个样本中分别检测到66和56个多态性位点，定义了32和28种单倍型，其中WT、CJ和CH群体Cytb基因的单倍型数分别为19、11和16，WT、CJ和CH群体COI基因单倍型数分别为15、13和15；遗传多样性分析Cytb基因表现出高单倍型多样性(0.981)和低核苷酸多样性(0.00 451)，而COI基因表现出高单倍型多样性(0.931)和高水平的核苷酸多样性(0.01 429)，表明红豆杉的遗传多样性较丰富；基于Cytb和COI基因序列WT和CH群体分别具8个和9个相同单倍型，说明野生东北红豆杉与韩杉的亲缘关系较近；分子方差分析(AMOVA)发现群体间的遗传变异(Cytb: 77.61%; COI: 64.36%)占比明显高于群体内的遗传变异(Cytb: 22.39; COI: 35.64%)，表明东北地区红豆杉群体遗传变异主要来源于群体间；群体单倍型系统发育树表明，WT、CJ和CH群体间互有交叉，推测韩杉可能是野生东北红豆杉和日本红豆杉互为父母本杂交而来。Tajima’s D和Fu and Li’s中性检验显著偏离中性，推测日本红豆杉CJ和韩杉CH群体可能经历过群体扩张事件，随后处于相对平衡稳定状态。

• 单位
  辽东学院