应用PCR-DGGE技术分析黄海冷水团海域的细菌群落组成

作者：刘敏; 朱开玲; 李洪波; 张涛; 肖天

来源：环境科学, 2008, (04): 1082-1091.

DOI：10.13227/j.hjkx.2008.04.029

• 细菌群落组成
• 16SrDNA序列分析
• PCR-DGGE
• 黄海冷水团 bacterial community composition
• 16S rDNA phylogenetic analysis
• Yellow Sea Cold Water Mass(YSCWM)

利用PCR-DGGE技术对2个季节(2006-04和2006-10)的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近(约17条),多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条,其多样性也较丰富;而在冷水团范围以外站位的条带少(约12条),其多样性较低.细菌16S rDNA V3区特征片段经DGGE分离、条带切割,共得到24条条带,克隆、测序后,进行系统进化分析,结果显示这24条带分别归属于2个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroides).在24条序列中有1...

• 单位
  国家海洋环境监测中心; 中国科学院海洋研究所; 卫星海洋环境动力学国家重点实验室; 国家海洋局第二海洋研究所; 中国科学院研究生院