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摘要
灯笼鱼科鱼类种类繁多,且同属鱼类形态学相近,因此利用分子标记对灯笼鱼进行准确的物种鉴定具有重要价值。为探讨线粒体细胞色素b基因(Cyt b)和12S r RNA基因在灯笼鱼科物种鉴定中的适用性,对西北太平洋采集的56尾灯笼鱼进行扩增,并进行序列对比与系统发育分析。研究表明,采集的样本包括6种灯笼鱼,分别为瓦氏角灯鱼(Ceratoscopelus warmingii)、长体标灯鱼(Symbolophorus californiensis)、粗鳞灯笼鱼(Myctophum asperum)、细泰勒灯鱼(Tarletonbeania crenularis)、日本背灯鱼(Notoscopelus japonicus)以及某背灯鱼属鱼类(Notoscopelus sp.)。核苷酸多态性分析显示,基于Cyt b基因的种内与种间遗传距离比基于12S r RNA基因的更大。比较灯笼鱼科2种基因序列的结构特征,发现Cyt b基因的种间平均遗传距离是种内平均遗传距离的25倍,12S r RNA基因的种间平均遗传距离是种内平均遗传距离的26倍,均符合作为DNA条形码的基本要求。系统进化分析显示,每种灯笼鱼均能形成独立分支,2个基因均能对6种灯笼鱼类进行鉴别;但在Cyt b基因构建的进化树中,每种鱼类能更好与数据库中已有的序列进行聚类。综上所述,Cyt b和12S r RNA作为DNA条形码可以有效地对灯笼鱼科鱼类物种进行鉴定,且Cyt b基因在系统进化关系的研究上具有更高的适用性。
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