4种薯蓣属植物GBSS基因的电子克隆与生物信息学分析

作者：陈知龙; 郑佳豪; 吴坤龙; 张壹

来源：浙江农业科学, 2022, 63(08): 1850-1854.

DOI：10.16178/j.issn.0528-9017.20213130

• 薯蓣属
• GBSS基因
• 电子克隆
• 序列分析

多种薯蓣属植物全基因组测序工作的完成,为利用生物信息学手段对薯蓣属植物的基因进行电子克隆、结构与功能分析以及分子进化分析提供了便利。淀粉是薯蓣属植物地下块茎的重要组成成分,颗粒结合淀粉合成酶(GBSS)是淀粉合成过程中控制直链淀粉合成的关键酶。本研究以文成糯米山药GBSS基因序列为探针,电子克隆方法获得参薯、几内亚白山药、灌丛薯蓣和盾叶薯蓣4种薯蓣属植物的GBSS基因序列。通过生物信息学分析方法,比较分析4种薯蓣属植物GBSS基因结构、蛋白质结构及系统发育特点。结果可为进一步研究薯蓣属植物GBSS基因及其编码蛋白调控淀粉合成的分子机制提供科学依据。