烟草卵形家族蛋白的全基因组鉴定与分析

作者:秦莉婷; 陈兴云; 吴辉; 陈钰栋; 耿伟博; 王暖春; 李军民; 曹长代; 张丽; 唐恒
来源:分子植物育种, 2022, 1-11.

摘要

卵形家族蛋白是一类具有OVATE结构域的蛋白质,是植物中特有的转录因子,可以编码转录抑制因子,提高植物抗性,调节生长发育等过程。本研究利用生物信息学等手段对烟草OFP (卵形家族蛋白)基因家族进行全基因组鉴定与分析,在烟草中鉴定出了43个OFP基因家族成员。系统发育分析表明,43个OFP具有较高的同源性;保守基序和基因结构分析表明,OFP大多含有两个以上的保守基序,基因结构具有相似性;理化性质及亚细胞定位结果表明,OFP家族成员编码的蛋白多为亲水性且多位于细胞核、线粒体、内质网、叶绿体等;顺式作用元件预测分析表明,烟草中OFP可能在烟草的生长发育、抵御逆境胁迫和激素调节等方面发挥着重要作用。基于此研究,我们可以进一步研究OFP具体功能,为烟草抗性提高提供新思路。