玉米ZmAGA3的生物信息学及基因表达特性分析

作者：张艳; 吴畅; 陈铭; 牟春霓; 刘卫娟^*; 邹华文^*

来源：安徽农学通报(上半月刊), 2022, 28(08): 36-56.

DOI：10.16377/j.cnki.issn1007-7731.2022.08.022

• 玉米
• ZmAGA3
• 生物信息学分析
• 非生物胁迫处理
• 基因表达

α-半乳糖苷酶(α-Galactosidase)属于糖苷水解酶家族，是棉子糖(RFO)分解代谢过程中的关键酶。为了探究玉米α-半乳糖苷酶基因ZmAGA3在玉米生长发育及应对非生物逆境过程中的功能，对玉米ZmAGA3(alkaline alpha-galactosidase 3)基因及其编码的蛋白质进行了生物信息学预测分析，并研究了ZmAGA3在不同非生物胁迫处理下的表达模式。结果表明，ZmAGA3编码747个氨基酸，相对分子质量81155.05，理论等电点(PI)6.59，总平均亲水性-0.146。ZmAGA3具有AmyAc＿family结构域(淀粉酶催化结构域)，主要由α-螺旋(26.77%)和无规则卷曲(42.97%)构成；可能发生磷酸化的位点共有46个，主要集中在丝氨酸上；与高粱、狗尾草的亲缘关系更近，与拟南芥和水稻的亲缘关系较远；在外源PEG、ABA、NaCl、H2O2的处理下，ZmAGA3基因的表达量均发生了上调。因此，ZmAGA3基因可能在响应非生物胁迫过程中发挥着重要作用，这为进一步揭示ZmAGA3基因的功能奠定了基础。

• 单位
  长江大学