连锁超市因会计电算化、会计资料高度集中化、税基难监控、商品繁多难盘存、商品损耗难核实、财务数据缺实、"店中店"难区分、财务票据和供应商难控管诸多问题,其税收难以征管,应重视超市的会计软件报备制度,加强增值税和所得税管理及销售商品、库存商品和商品损耗的监管,加强对财务数据和票据管理,加强对"店中店"和供应商的监管。