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摘要
目的 分析斑马鱼E3泛素蛋白连接酶1(MIB1)基因启动子区转录因子结合位点(TFBS),MIB1互作基因和互作蛋白的种类及其在信号通路中的作用，探讨MIB1基因的调控方式及潜在功能。方法 利用国家基因组科学数据中心(NGDC)预测非编码RNA(ncRNA),利用Alggen与AnimalTFDB在线网站预测MIB1基因TFBS种类，使用GeneMANIA与STRING分析MIB1的互作基因与互作蛋白；通过DAVID网站获取相关数据，进行基因本体(GO)可视化分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析。结果 MIB1基因启动子区及5′非翻译区可转录出ncRNA;通过预测得到121种TFBS,并发现P53转录因子既可以结合到MIB1基因的启动子区又可与MIB1蛋白相互作用；在线预测出6种MIB1的共表达基因，筛选出20种互作基因；通过GO可视化分析发现，MIB1及其互作基因在生物过程方面具有调控细胞、组织、器官生长分化及调节NOTCH信号通路等功能，且主要在细胞质核周区、细胞膜和突触后密集区等部位被富集，具有结合NOTCH蛋白、PDZ结构域蛋白等分子功能；KEGG代谢通路分析发现，MIB1及其互作基因涉及4条代谢途径。结论 MIB1包含多种TFBS,并通过与特定转录因子的相互作用，影响细胞癌变、免疫调节等多种生物学过程。MIB1还可能通过其互作基因和互作蛋白的介导，在细胞生长调控、造血干细胞分化、胚胎发育及神经元信息的传递等方面发挥重要作用。
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