摘要
为探究双荚决明叶绿体基因组基因含量、结构及重复序列,本研究以双荚决明为研究对象,进行叶绿体全基因组测序。将双荚决明总DNA作为材料进行建库测序,采用Illumina HiSeq 4000-PE150平台进行测序,构建出双荚决明叶绿体基因组图谱并进行生物信息学分析。研究结果表明,双荚决明叶绿体基因组全长为161 056 bp,反向重复序列IRa和IRb的长度均为26 041 bp,LSC和SSC长度分别是90 416,18 558 bp。叶绿体基因组的总GC含量为36.2%,其中IR区GC含量为42.6%。双荚决明叶绿体基因组共编码129个基因,包含84个蛋白质编码基因。由贝叶斯法构建的35种双子叶植物的系统发育树显示出双荚决明和望江南亲缘关系最接近,其次是决明。在35种双子叶植物的的系统发育树中,相同属的物种聚在一起,聚类效果较好,能够较好的反映双荚决明在豆科以及双子叶植物中的演化位置和进化关系。本研究解决了决明属植物系统发育关系,研究结果为双荚决明的物种鉴定、系统进化及资源开发利用等提供新的证据和材料基础。
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单位苏州农业职业技术学院; 生命科学学院; 西华师范大学