影响细菌种群(太岁组织)结构关键因素的研究

作者：王朝江; 李慧; 王世清; 高春燕; 李聪; 张洋; 刘方^*

来源：南开大学学报(自然科学版), 2022, 55(03): 73-80.

• 太岁
• 细菌
• 组织前处理
• DNA提取
• 菌群结构

探索了太岁取样部位和DNA提取前处理2个因素对细菌菌群结构的影响,并获知真实的优势菌群信息.对表里部位重复取样样品,施加水浸提、热溶解与微孔过滤组合成的3种前处理,提取的DNA用Miseq平台测序,挖掘出共有、占比高、有最高丰度OTU支撑的菌群.发现太岁中细菌种类丰富,大部分是杂菌,由表至内,多数类群不明原因消失,多样性和丰度降低,假单胞菌属(Pseudomonas)丰度显著升高;其与不动杆菌属(Acinetobacter)、根瘤菌属(Rhizobium)和鞘脂菌属(Sphingobium)为共有优势属;3种前处理方法获得的菌群结构近似,以内部组织直接热溶解过膜法为最优,其假单胞菌属占比达48.32%.

• 单位
  河北省农林科学院