基于序列特征预测先天性糖基化紊乱疾病基因

作者：龙伟; 周艳红

来源：华中科技大学学报(自然科学版)科技大学, 2009, 37(8): 120-124.

DOI：10.3321/j.issn:1671-4512.2009.08.032

• 生物信息学
• 统计
• 算法
• 先天性糖基化紊乱
• 疾病基因预测
• 序列特征

选取mRNA和protein序列的330个物化特征进行研究,发现某些特征在已知的先天性糖基化紊乱(CDG)疾病基因中具有共同显著性差异.基于这个特点设计了一种新的CDG疾病基因预测方法,留一法交叉验证结果表明该方法能够有效地从众多候选基冈中预测出真实的CDG基因,效果略优于其他预测方法.本方法只需要知道mRNA和protein的序列数据,弥补了目前蛋白质功能、相互作用等数据不足或不可靠的缺陷.进一步对其他疾病基因的预测结果表明本方法具有一定的推广性.

• 单位
  华中科技大学