奶牛TLR2基因核苷酸突变位点筛选及序列特征分析

作者：彭帅; 郑天宇; 任稳稳; 陈朗; 张丽; 刘丽霞^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(11): 5026-5031.

DOI：10.13417/j.gab.039.005026

• 中国荷斯坦牛
• TLR2基因
• 序列特征

采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,对中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区核苷酸突变位点进行筛选,构建TLR2基因系统进化树,通过生物信息学方法预测并分析中国荷斯坦牛TLR2蛋白的理化性质及结构特征。结果表明,中国荷斯坦牛TLR2基因CDS区共有5个核苷酸突变位点(T189G, G455A, A631G, C1632T和T1707C),且中国荷斯坦牛与新疆褐牛、野牛高度同源(99.2%)。序列特征分析结果表明,中国荷斯坦牛TLR2蛋白由784个氨基酸组成,并同时含有亮氨酸重复序列(LRRs)和Toll同源结构域(TIR)的不稳定亲水性跨膜功能蛋白质。本研究结果揭示了TLR2基因结构特点和蛋白质理化性质,为该基因作用机理的深入研究和牛的抗病育种提供理论基础。

• 单位
  西北民族大学