草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测

作者：李偲; 刘航; 黄容; 李华英; 石米娟; 廖兰杰; 朱作言; 汪亚平

来源：水生生物学报, 2011, (04): 681-687.

• 草鱼
• 微卫星标记
• 多态信息含量 Grass carp(Ctenopharyngodon idellus)
• Microsatellite marker
• Polymorphism Information Content(PIC)

表达序列标签(EST)是发掘Ⅰ型微卫星标记的重要资源。研究运用生物信息学方法,从草鱼头肾组织3027条EST序列中搜索到322个微卫星位点,占整个EST数据库的10.6%。其中,二核苷酸重复位点151个(46.9%),三核苷酸重复位点137个(42.5%),四、五、六核苷酸重复位点较少;在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的50.3%,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的40.4%,AT和GC重复较少。10个微卫星位点的多态性检测结果显示,4个位点在草鱼测试群体中呈多态性,多态性位点的平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合度(H)分别为0.5236...

• 单位
  中国科学院水生生物研究所; 中国科学院研究生院; 淡水生态与生物技术国家重点实验室