摘要
目的观察低温缺血再灌注心律失常大鼠心室肌长链非编码RNAs(lncRNAs)表达谱的变化。方法清洁级健康雄性SD大鼠,3~4月龄,体重320~390 g,成功制备离体心脏低温缺血再灌注模型16个,采用随机数字表法分为2组(n=8):对照组(C组)和低温缺血再灌注损伤组(I/R组)。采用全心停灌60 min再灌注30 min的方法制备心脏低温缺血再灌注损伤模型。记录再灌注期间心律失常的类型、频率及持续时间,根据室性心律失常评分将I/R组大鼠分为低危组(I/R-L组)和高危组(I/R-H组)。再灌注结束后取左心室心肌组织进行高通量测序,筛选差异表达的lncRNAs,采用qRT-PCR法随机挑选4个显著差异表达的lncRNAs进行验证,并采用生物信息学方法预测其靶基因,利用Gene Ontology、KEGG通路等数据库对差异表达lncRNAs的靶基因进行富集分析。结果与C组比较,I/R-L组表达上调的lncRNAs有124个,下调的lncRNAs有137个,I/R-H组上调的lncRNAs有100个,下调的lncRNAs有139个。与I/R-L组比较,I/R-H组表达上调的lncRNAs有121个,下调的lncRNAs有118个。3组间表达量变化绝对值≥2且显著差异表达(P<0.01)的lncRNAs有68个。其中,与C组比较,I/R-L组表达显著上调的lncRNAs有40个,表达显著下调的有55个,I/R-H组表达显著上调的lncRNAs有42个,表达显著下调的有48个。与I/R-L组比较,I/R-H组显著上调的lncRNAs有52个,下调的有40个。随机选取4个lncRNAs (MSTRG.136297.1、MSTRG.81170.3、MSTRG.60110.2和MSTRG.97622.63)进行qRT-PCR验证,证实测序结果可靠。这些差异表达lncRNAs的靶基因参与调控的与再灌注心律失常相关的生物过程有17个、KEGG通路有9个,且细胞内钙离子浓度的正向调节和心肌细胞肾上腺素能信号通路分别为差异表达lncRNAs的靶基因富集程度最高的生物学过程和KEGG通路。结论全心低温缺血再灌注后,大鼠心室肌lncRNAs表达谱发生了显著性改变,这些显著差异表达的lncRNAs可能主要通过调控钙离子跨膜转运及心肌细胞中的肾上腺素能信号通路,从而导致再灌注心律失常的发生。
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单位贵州医科大学; 贵航贵阳医院; 织金县人民医院; 贵阳市第四人民医院; 上海交通大学医学院附属仁济医院