杨梅全基因组的GATA转录因子鉴定、功能及进化分析

作者：易雨憧; 廖文海; 孙进; 朱哲宁; 程焱; 曹世江^*

来源：福建农林大学学报（自然科学版）, 2022, 51(05): 644-653.

DOI：10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2022.05.010

• 杨梅
• GATA转录因子
• 全基因组鉴定
• 进化分析

对杨梅GATA转录因子进行全基因组鉴定，并预测其理化特性、染色体定位、基因结构、蛋白保守序列等基本特征.结果表明，26个GATA转录因子随机分布在8条染色体上，共分为4个亚家族，并且各亚家族的成员在保守基序、结构域及基因结构上均存在一定的差异性.物种共线性结果表明，基因复制和片段性的重复事件可能是部分MrGATA演变的主要驱动力，MrGATA在不同组织和发育时期的表达数据说明各亚家族之间也存在功能上的差异.根据顺式作用元件及表达模式推测了GATA转录因子家族成员的功能.这些数据为探究杨梅MrGATA功能以及分子育种提供了依据.

• 单位
  福建农林大学