基于Oncomine及TCGA数据集分析结肠肿瘤中HMGB1基因的表达及预后价值

作者：苏献豪; 王会鹏; 陈文杰; 沈家门; 叶桃; 蔡元坤^*

来源：中华结直肠疾病电子杂志, 2020, 9(06): 552-557.

• 结肠肿瘤
• HMGB1
• Oncomine
• TCGA
• 生存分析

目的研究结肠肿瘤中高迁移率族蛋白B1基因(HMGB1)的差异表达及预后价值。方法从Oncomine及TCGA数据集中筛选出2 191例结肠肿瘤患者HMGB1基因表达数据及临床病理数据,采用Mann-Whitney U检验比较结肠癌与腺瘤、左半结肠癌与右半结肠癌、原位癌与浸润癌、黏液性腺癌与其他病理类型结肠癌、以及发生淋巴结转移与无淋巴结转移、发生远处转移与无远处转移结肠癌组织中HMGB1基因差异表达情况,并绘制Kaplan-Meier生存曲线。结果 HMGB1基因在结肠癌组织和腺瘤组织中均较正常结肠组织高表达(P<0.001),在结肠癌组织中较结肠腺瘤组织中高表达,在左半结肠癌组织中较右半结肠癌高表达(P<0.05),在黏液性腺癌组织中较其他病理类型低表达(P<0.05),在浸润癌组织中较原位癌高表达(P<0.001)。有淋巴结转移及远处转移者较未转移者高表达(P<0.05)。HMGB1基因高表达提示更高的5年生存率(P=0.011),尤其对于女性结肠癌患者(P=0.006)。结论 HMGB1基因可作为判断结肠癌浸润深度、淋巴转移、远处转移及预后的标志物。

• 单位
  复旦大学; 上海市第五人民医院