藏族外周血淋巴细胞表达序列标签分析

作者：陈云天; 徐树青; 童晓梅; 郑晓光; 于军; 格日力

来源：山东医药, 2010, (44): 50-52.

• 藏族
• 淋巴细胞
• 表达序列标签
• 单核苷酸多态性 tibetan
• lymphocyte
• expressed sequence tags
• single nucleotide polymorphism

目的对藏族外周血淋巴细胞cDNA文库进行随机大规模表达序列标签(ESTs)测序并进行生物信息学分析,通过序列比对找到与低氧适应相关基因有关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。方法将部分文库经大肠杆菌BM 25.8质粒化,用5′端测序引物进行测序,利用BLAST程序对获得的ESTs从核苷酸和氨基酸水平进行同源性搜索和比对。结果经序列比对发现突变位点较多发生在UTR区域,同时一些基因的编码区域也发生蛋白序列的变化。对这些基因注释后发现,有些突变发生在与能量代谢、线粒体相关的基因及一氧化氮合酶上,如GTPase、NDUFA6、ATP5L、NOSIP。结论 ESTs技术是一个快速、有效寻找新基因的方法 ...

• 单位
  中国科学院北京基因组研究所; 青海大学; 上海市第五人民医院; 复旦大学