玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析

作者:练冬梅; 赖正锋; 姚运法; 张少平; 林碧珍; 洪建基*
来源:江苏农业科学, 2020, 48(06): 41-45.
DOI:10.15889/j.issn.1002-1302.2020.06.008

摘要

以玫瑰茄(Hibiscus sabdariffa Linnaeus)花瓣和花萼为研究对象,采用Illumina HiseqTM 2500高通量测序技术,对花瓣和花萼进行转录组测序及花青素合成相关基因差异表达分析。结果表明,花瓣和花萼共获得13.94 Gb有效数据(clean data),Q30碱基百分比均达到93.0%以上;共获得1 399个差异表达基因(DEGs),包括65个上调基因,1 334个下调基因,且功能注释的基因有1 176个;筛选出了与花青素合成相关结构基因CHI、FLS、ANR、CHI在花萼中表达显著,FLS、ANR在花瓣中表达显著。本研究丰富了花青素相关研究,可为阐明玫瑰茄花青素合成机制提供理论依据。

  • 单位
    福建省农业科学院

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