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摘要
DNA甲基化几乎与所有类型的癌细胞和基因组区域异常有关,识别与肿瘤相关的差异甲基化位点可作为肿瘤纯度的估算指标,进而评估样本的肿瘤纯度。传统的信息差异位点的选择多关注肿瘤间的异质性,忽略了肿瘤生长空间的异质性,导致评估的肿瘤纯度忽视了样本的特异性。因此,论文基于DNA甲基化数据及样本位点的信息熵,通过选择具有样本特异性的信息差异甲基化位点来估算肿瘤样本的纯度。实验结果表明:论文方法估算出的肿瘤纯度结果与其他方法具有高度一致性。
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DNA甲基化几乎与所有类型的癌细胞和基因组区域异常有关,识别与肿瘤相关的差异甲基化位点可作为肿瘤纯度的估算指标,进而评估样本的肿瘤纯度。传统的信息差异位点的选择多关注肿瘤间的异质性,忽略了肿瘤生长空间的异质性,导致评估的肿瘤纯度忽视了样本的特异性。因此,论文基于DNA甲基化数据及样本位点的信息熵,通过选择具有样本特异性的信息差异甲基化位点来估算肿瘤样本的纯度。实验结果表明:论文方法估算出的肿瘤纯度结果与其他方法具有高度一致性。
