人翼状胬肉中miR-486-3p的表达及其潜在靶基因的生物信息学分析

作者：徐玉亭; 乔晨; 何思颖; 董世栖; 徐云峰; 严明^*

来源：国际眼科杂志, 2021, 21(06): 969-974.

• 翼状胬肉
• miR-486-3p
• 靶基因
• 生物信息学分析

目的:通过检测人翼状胬肉组织及正常结膜组织中miR-486-3p的表达情况,探寻其在翼状胬肉发生发展中可能的作用机制。方法:于2018-09/2019-12收集原发性翼状胬肉患者69例69眼,收集术中切除的翼状胬肉组织和术眼正常结膜组织,采用RT-PCR定量检测标本中miR-486-3p的相对表达量,并利用Targetscan数据库、miWalk3.0数据库、miRDB数据库对miR-486-3p进行靶基因预测后将得到的潜在靶基因取交集;采用DAVID数据库对miR-486-3p潜在靶基因进行功能和通路富集分析;采用String网站对miR-486-3p潜在靶基因进行互作分析。结果:miR-486-3p在翼状胬肉组织中的相对表达量[(6.183±1.366)×10-6]与正常结膜组织的相对表达量[(7.930±1.394)×10-5]有显著差异(P<0.0001)。通过对其靶基因预测及生物信息学分析发现miR-486-3p潜在靶基因436个,其生物学功能主要富集于对RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的调控、囊泡介导的转运和转录调控、DNA依赖性RNA代谢过程的调控。KEGG通路主要富集于神经轴突导向(Axon guidance)通路及溶酶体通路上,其中Axon guidance通路可能对翼状胬肉的发生发展起着重要的调控作用。PPI网络分析进一步表明Axon guidance通路中的关键基因ABL1、PLXNA1对翼状胬肉具有重要作用。结论:miR-486-3p可能通过SLIT(神经导向因子Slit)/Robo(回旋引导受体)和SEMA3A(神经导向因子Semaphorin 3A)/PLXNA1(丛蛋白受体A1)等Axon guidance通路致翼状胬肉的新生血管异常,从而参与翼状胬肉的发生、发展。

• 单位
  武汉大学; 第二临床学院; 武汉大学中南医院; 爱尔眼科医院