基于16S rRNA序列对4种扇贝4个群体亲缘关系分析

作者：相明玥; 曾令坤; 李祯; 田莹; 常亚青; 丁君

来源：中国渔业质量与标准, 2018, 8(03): 68-74.

• 扇贝
• 16S rRNA
• 亲缘关系
• 遗传距离
• 系统发育树
• PCR扩增

大连市场上出现一种与栉孔扇贝(Chlamys farreri)形态结构相似的扇贝,被人们俗称为"俄罗斯栉孔扇贝"。为了探究其与3种常见扇贝的亲缘关系,本研究利用16S rRNA基因序列,将"俄罗斯栉孔扇贝"分别与中国地区的栉孔扇贝(Chlamys farreri)、海湾扇贝(Argopecten irradians)、虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)以及美国大西洋地区的海湾扇贝(Argopecten irradians)和日本地区的虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)等不同地区群体的扇贝进行遗传学对比分析,并结合Gen Bank中其他双壳贝类16S rRNA序列分析碱基组成,计算种间遗传距离,构建系统发育树,明确该扇贝的分类地位。结果显示:4种碱基(A、T、G、C)各自的含量较为接近,且这4种扇贝的基因片段中,A+T的含量均高于G+C的含量,这与其他贝类16S rRNA基因片段的研究结果相一致。16S rRNA(长牡蛎为外群)的双壳贝类系统发育树分析显示,与该扇贝亲缘关系由近及远分别是虾夷扇贝、栉孔扇贝、赭类栉孔扇贝、华贵栉孔扇贝、海扇贝、海湾扇贝和长牡蛎。该扇贝与虾夷扇贝遗传距离最近(0.073),且其与栉孔扇贝遗传距离已达到种间差异水平。序列对比结果说明该"俄罗斯栉孔扇贝"是岛扇贝(Chlamys islandica)。本研究将为在分子水平上了解不同地区的4种扇贝群体遗传背景提供信息。

• 单位
  生命学院; 大连海洋大学; 农业部