两种尼罗罗非鱼GHR、IGF-Ⅰ基因启动子区及编码区多态性与生长性状的相关性分析

作者：陈炳霖; 肖炜; 邹芝英; 祝璟琳; 李大宇; 喻杰; 杨弘^*

来源：农业生物技术学报, 2020, 28(11): 2032-2047.

• 罗非鱼
• 启动子区
• 编码区
• 优势生长性状
• 分子标记

GH-IGF信号通路对鱼类的生长起到重要的调控作用。为探寻生长激素受体(growth hormone receptor, GHR)和类胰岛素生长因子Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ, IGF-Ⅰ)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)分子标记与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)优势生长性状的相关性,本研究利用Sanger测序技术从吉富品系(JF)和埃及品系(AJ)两种尼罗罗非鱼GHR1、GHR2和IGF-I基因启动子区和编码区共筛选出32个SNPs位点。以是否引起序列功能改变为条件进行SNPs的二次筛选,在JF群体中共保留9个SNPs位点,分布于GHR1基因(7个)和GHR2基因(2个)中;在AJ群体中共保留5个SNPs位点,分布于GHR1基因(4个)和GHR2基因(1个)中。通过一般线性模型(general linear model,GLM)及最小二乘分析(least-significant difference, LSD)对两种罗非鱼的子代群体进行SNPs与生长性状的相关性分析,结果显示,在JF群体GHR1和GHR2基因中共发现6个与优势生长性状显著相关的SNPs位点(P<0.05),而AJ群体中并未发现与优势生长性状显著相关的SNPs位点及基因型。以上结果可作为罗非鱼分子辅育过程中的候选分子标记,并为生长相关因子在鱼类中的后续功能研究提供理论依据。

• 单位
  中国水产科学研究院淡水渔业研究中心; 农业部