以国家“卓越工程师教育培养计划”的培养目标，构建了“厚基础、宽口径、重实践、强融合”四位一体“3+1”式的制药工程专业“卓越工程师”人才培养体系。通过遴选方式实施、导师制管理、线上线下、校内校外、仿真与实训方法，进行了专业夯实基础、宽口径、强化融合，重视实践的探索，实现制药工程专业“卓越工程师”创新应用型人才知识、能力和素养高质量培养，以适应行业的需求。
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