云南水稻新品系重要农艺性状全基因组关联分析

作者：杨丹丹; 李小林; 吕莹; 邓伟^*; 徐雨然; 奎丽梅; 涂建; 谭静^*

来源：西南农业学报, 2023, 36(09): 1825-1834.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2023.9.001

• 水稻
• 新品系
• 农艺性状
• 全基因组关联分析

【目的】探究云南省新育成水稻品系控制重要农艺性状的基因，为下一步精准利用这些基因做好准备。【方法】选用云南省农业科学院育成的124份水稻新品系为试验材料，利用全基因组关联分析技术对水稻剑叶长、剑叶宽、株高、有效穗数、穗长、每穗粒数、结实率、千粒重8个重要农艺性状进行相关位点的挖掘。【结果】通过表型性状分析，从124份水稻新品系中共鉴定出33份大穗材料，8份大粒材料；通过聚类分析，参试群体被分成群体Ⅰ、群体Ⅱ、群体Ⅲ;通过全基因组关联分析，8个重要农艺性状共检测到204个相关位点(P≤0.001),阈值超过1.0×10-5的位点有39个，其中与剑叶长显著关联的SNP位点5个，与剑叶宽显著关联的SNP位点1个，与株高显著关联的SNP位点4个，与有效穗数显著关联的SNP位点3个，与穗长显著关联的SNP位点4个，与每穗粒数显著关联的SNP位点6个，与结实率显著关联的SNP位点2个，与千粒重显著关联的SNP位点14个，其中qFLW1、qPH6.1、qTGW3.1、qTGW3.2、qTGW3.3、qTGW3.4、qTGW7 7个位点与前人研究一致，其余位点为新位点；8份大粒材料位点分析结果显示，有7份材料在8号染色体的3个位点上集中出现，有5份材料在11号染色体的1个位点上集中出现，其余位点上均未筛选到相关材料。【结论】发掘水稻控制重要农艺性状的基因，为下一步分子标记辅助选择育种提供有用信息。

• 单位
  云南省农业科学院粮食作物研究所; 云南大学