本发明公开了一种合成鸟苷二磷酸岩藻糖的重组毕赤酵母及其构建方法与应用,所述重组毕赤酵母是通过在毕赤酵母GS115的基因组表达岩藻糖-1-磷酸鸟苷转移酶和岩藻糖激酶得到的。通过改造获得了可合成鸟苷二磷酸岩藻糖的菌株,可以高效合成鸟苷二磷酸岩藻糖。本发明重组毕赤酵母的构建方法简单,便于使用,具有很好的应用前景。