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摘要
目的 利用转录组测序技术和生物信息学分析方法研究低氧对小胶质细胞系BV2细胞基因表达水平的影响，探讨低氧诱导BV2细胞代谢紊乱的分子机制。方法 分别对1%(体积分数)低氧和21%(体积分数)常氧处理12 h和24 h的BV2细胞进行转录组测序，采用生物信息学分析方法筛选显著差异表达基因(DEGs),并对显著DEGs进行聚类分析、基因本体(GO)功能注释分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析及蛋白质相互作用网络(PPI)分析。使用Cytoscape软件筛选与代谢相关的排名前10位的关键基因。利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对关键基因进行验证。结果 低氧处理12 h共筛选860个显著DEGs(|log2FC|≥1,Q≤0.05),其中672个上调基因，188个下调基因。KEGG和GO分析发现低氧处理后显著DEGs显著富集在细胞周期、HIF-1信号通路、Rap1信号通路、碳代谢、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢、淀粉和蔗糖代谢及氨基酸等代谢进程。低氧组处理24 h共有587个显著DEGs(|log2FC|≥1,Q≤0.05),其中498个上调基因，89个下调基因。KEGG和GO分析显示低氧处理后显著DEGs显著富集在HIF-1信号通路、TGF-β信号通路、IL-17信号通路、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢、淀粉和蔗糖代谢和氨基酸等代谢进程。低氧分别处理12 h和24 h,显著DEGs中有410个相同基因，410个相同基因中与代谢相关的前10个关键基因是PFKL、TPI1、PFKP、PGK1、ALDOART1、HK2、GPI1、ALDOA、ALDOC、GAPDH。RT-qPCR结果显示，低氧能够促进PFKL、TPI1、PFKP、PGK1、GPI1、ALDOC等代谢相关基因的表达。结论 低氧可诱导BV2细胞代谢发生紊乱，这可能主要和PFKL、TPI1、PFKP、PGK1、GPI1、ALDOC等基因表达异常相关。
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