液相芯片技术快速检测及基因多态性

作者：许红丽; 邓任堂; 陈梅莲; 陈载鑫; 黄志宏; 司徒博; 孔桂兴; 赖丽莎; 郑磊; 付文金^*

来源：中华检验医学杂志, 2019, (12).

• 液相芯片
• 等位基因特异性引物延伸
• 华法林
• 氯吡格雷
• 单核苷酸多态性

目的 基于液相芯片技术,建立一种可同时、快速检测细胞色素P450 2C9(cytochrome P450 2C9,CYP2C9)、CYP2C19、CYP4F2、维生素K环氧化物还原酶(vitamin K epoxide reductase,VKORC1)及ATP结合盒亚家族B成员1(ATP-binding cassette subfamily B member1,ABCB1)等与华法林和氯吡格雷相关药物基因多态性的方法。方法 方法学的建立。从Genbank中查找与华法林和氯吡格雷药物相关的8个靶位点附近基因序列,设计特异性引物和探针；通过多重PCR扩增,等位基因特异性引物延伸(allele specific primer extension, ASPE),MagPlex-Tag微球杂交,经液相芯片系统Luminex 200检测荧光信号,确定基因型；优化反应体系并进行方法学评价。收集2017年6月至2018年12月东莞市厚街医院抗血栓治疗患者血液样本,共260例,采用建立的方法检测其8个靶位点,并与测序结果比较。结果 本方法检测260例样本结果显示：纯合子荧光强度中位值(median fluorescence intensity, MFI)比率均>0.9或<0.1,杂合子MFI比率均在0.3～0.6之间；各基因型批内和批间变异系数分别低于6.4%和10.9%；所需DNA最低检测限为0.75 ng；260例样本的检测结果与测序结果完全一致。结论 本研究采用液相芯片技术,成功建立了快速检测华法林和氯吡格雷相关药物基因型的方法。

• 单位
  南方医科大学南方医院; 武冈市人民医院; 广东省东莞市厚街医院