摘要
目的:通过挖掘原发性肝细胞癌(HCC)发病和疾病发展中的关键基因,研究HCC差异表达mRNA参与的分子功能和生物学过程。方法:从exoRBsase数据库中下载2021年4月至2022年5月健康人群与HCC相关的RNA(包括mRNA、lncRNA、circRNA)表达谱数据,其中正常血样本32例,HCC样本21例。应用R语言筛选出在exoRBase外泌体数据库HCC患者外周血中差异表达的外泌体基因,通过在线数据库和Cytoscape软件构建ceRNA网络,对关键基因进行可视化分析,并对差异表达的mRNA关键基因进行GO和KEGG富集分析。结果:筛选出HCC患者外周血中差异表达的外泌体mRNA160个,lncRNA62个,circRNA18个;通过构架ceRNA网络,发现mRNA、lncRNA、circRNA竞争性地结合miRNA,且差异表达的mRNA关键基因的GO和KEGG富集分析结果显示,主要与蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性、GTPase激活活动相关。结论:exoRBase外泌体数据库筛选出健康人群和HCC患者外周血外泌体具有显著差异性,且mRNA、lncRNA和circRNA可以竞争性地与HCC相关的miRNA结合,实现相互调控。这些基因参与了HCC的发生和发展,可以作为治疗HCC的新靶点。
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