摘要

为了明确bHLH转录因子家族在萱草海水胁迫下的表达特性,以萱草(Hemerocallis fulvaL.)‘秋红’为实验材料,基于转录组测序结果,通过生物信息学分析对海水胁迫下萱草bHLH转录因子家族基因进行鉴定,利用qRT-PCR技术检测海水胁迫对萱草bHLH转录因子家族基因表达的影响。结果表明,海水胁迫下萱草的转录组数据库中共筛选出29个具有bHLH转录因子保守结构域的bHLH转录因子,55.17%的bHLH转录因子家族基因编码蛋白呈弱酸性,且29条编码蛋白均属于亲水蛋白。亚细胞定位预测显示萱草bHLH转录因子家族基因编码蛋白主要在细胞核、叶绿体和细胞质中表达。保守基序分析显示萱草bHLH转录因子家族基因编码蛋白含有的保守元件中有1个保守结构域的特征保守基序,有24个编码蛋白含有该基序,出现频率最高。进化分析显示,萱草中29个bHLH转录因子家族成员可分为8个亚族,其中第3亚族中包含7个bHLH转录因子成员最多。基因差异表达分析显示,萱草bHLH转录因子基因在海水胁迫不同时间下,差异倍数上调的基因多于下调的基因。qRT-PCR分析结果表明,HfbHLH-01和HfbHLH-16在海水胁迫72h时,bHLH的相对表达量升高,推测HfbHLH-01和HfbHLH-16可能与bHLH的抗逆性有关,可为萱草逆境胁迫机制研究提供参考。