206株中国环境分离嗜肺军团菌1型菌株基因序列分型研究

作者：任红宇; 周海健; 李马超; 朱兵清; 邵祝军; 秦天

来源：疾病监测, 2015, 30(02): 97-102.

• 嗜肺军团菌
• 基因序列分型
• 种群结构分析
• 不同自然环境来源

目的对中国不同自然环境来源分离的嗜肺军团菌血清1型菌株进行分子分型和种群结构分析。方法应用7个基因(fla A、pil E、asd、mip、momp S、pro A、neu A)序列分型方法(Sequence based typing,SBT)对不同环境来源的206株嗜肺军团菌血清1型菌株进行分型研究,通过查询嗜肺军团菌SBT数据库(http://www.ewgli.org)和用Bio Numerics软件构建最小生成树揭示菌株的分子分型和种群结构特征。结果 206株菌分成54个ST型(IOD=0.7205)。其中49株温泉水分离株分成25个ST型(IOD=0.9498),各位点Nei指数0.77210.8563;130株冷却塔水分离株分成31个ST型(IOD=0.6453),各位点Nei指数为0.42270.4970;27株管道水分离株分成3个ST型(IOD=0.1453),各位点Nei指数为0.14250.1453。ST1型含108株菌,占52.4%,是优势带型。54个ST型形成5个克隆群。通过中国菌株和其他20个国家的菌株综合分析,共计1199株菌分成304个ST型,形成21个序列群。其中ST-1型为全球优势型别,其余型别和序列群呈地区性分布特征。结论中国环境分离的嗜肺军团菌1型菌株具有高度复杂的基因多态性和种群结构,其中ST1是我国也是全球环境菌株的优势型别。

• 单位
  中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室