基于SSR标记的云南地方稻种群体内遗传多样性分析

作者：孙建昌; 余滕琼; 汤翠凤; 曹桂兰; 徐福荣; 韩龙植

来源：中国水稻科学, 2013, 27(01): 41-48.

• 水稻
• 地方品种
• 群体内遗传多样性
• 微卫星标记

用20对SSR引物对原产于云南的16份地方稻种和2份选育品种进行单个品种群体内的遗传多样性分析。结果表明,87.5%的地方品种群体内SSR多态性高于选育品种,而12.5%的地方品种群体内SSR标记多态性与选育品种相近。81.2%的地方稻种群体内的等位基因数(Na)和Nei基因遗传多样性指数(He)高于选育品种,而18.8%的地方品种群体内Na和He与选育品种相同或略小。水稻地方稻种群体内He的差异较大,其变异范围为0.0146～0.5117,其中,黄板所-1(1980年收集)、黄板所-2(2007年收集)、麻线谷-1(1980年收集)、麻线谷-2(2007年收集)的群体内遗传多样性较高,分别为0.2327、0.4214、0.5117和0.4489。87.5%地方品种的杂合度(Ho)明显高于选育品种;地方品种群体间遗传多样性差异很大,其中1/4的遗传差异来源于地方稻种群体内,差异极显著。RM333、RM257和RM180在供试云南地方稻种群体内的多态性、等位基因数、多样性指数和变异百分率均较高,适用于云南地方稻种群体内遗传多样性检测。

• 单位
  中国农业科学院作物科学研究所; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所; 宁夏农林科学院农作物研究所; 农业部