基于生物信息学分析NEIL3在肝细胞癌中的表达及其临床意义

作者：张建国; 何亮; 王久阳; 姜涛

来源：东南大学学报(医学版), 2022, 41(03): 386-393.

• 肝细胞癌
• Nei核酸内切酶Ⅷ样3
• 生物信息学

目的:基于生物信息学分析Nei核酸内切酶Ⅷ样3(Nei endonucleaseⅧ-like 3, NEIL3)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达和临床意义。方法:利用TCGA数据库的mRNA数据和临床数据分析NEIL3在肝细胞癌中的表达和临床意义。使用GEPIA和Kaplan-Meier数据库分析NEIL3表达对HCC患者预后的影响。使用UALCAN和cBioPortal数据库分析NEIL3在HCC中的甲基化水平。使用STRING、Metascape和LinkedOmics探索NEIL3在HCC中的潜在作用机制。结果:与正常组相比，NEIL3在HCC显著高表达。临床相关性分析结果显示，NEIL3表达与患者的病理分期及肿瘤大小呈负相关。Kaplan-Meier生存曲线显示，NEIL3高表达与HCC患者较差的总体生存期、无病生存期、无进展生存期、无复发生存期有关。表观遗传学研究发现，NEIL3基因的低甲基化可能是NEIL3在HCC中表达上调的原因之一。功能富集分析发现，NEIL3可能通过参与细胞周期、DNA复制、同源重组、错配修复、p53信号通路、碱基切除修复、剪接体和乙型肝炎相关等信号通路促进HCC发生发展。结论:生物信息学分析显示，NEIL3在HCC组织中显著高表达，且与患者的不良临床结局相关，可作为HCC的潜在治疗靶点和预后生物标志物。

• 单位
  北京市平谷区医院