长江流域水资源保护局通过长期探索与实践,已在长江流域逐步完善了水功能区管理体系,水功能区已经成为当前最重要的水资源保护制度。本文回顾了长江流域水功能区管理制度及体系的起步、发展和完善历程,梳理了长江流域水功能区保护管理取得的经验、成效和在实践中发现的问题,并相应提出了对策建议。