细粒棘球绦虫胰岛素受体蛋白的生物信息学分析

作者：王芬; 胡容; 李龙; 黎昆; 赵明才; 陈林; 刘家瑞^*

来源：中国病原生物学杂志, 2020, 15(11): 1295-1298.

DOI：10.13350/j.cjpb.201111

• 细粒棘球绦虫
• 胰岛素受体
• 生物信息学
• 分子特性

目的采用生物信息学软件分析细粒棘球绦虫胰岛素受体(EgIR)蛋白的分子特性,并分析其功能。方法从NCBI蛋白质数据库中下载EgIR的氨基酸序列,采用SignalP 4.1、ProtParam、SMART、NetPhos 3.1等在线分析程序预测EgIR蛋白的信号肽序列、理化性质、保守结构域及磷酸化位点;采用Pairwise Sequence Alignment Tools分析EgIR与其他物种来源IR间的序列一致性;采用MEGA 6.06程序对不同物种来源的IR蛋白进行多序列比对并构建进化树,进行系统分析。结果 EgIR蛋白由1661aa组成,为一种亲水性的非分泌跨膜蛋白。EgIR蛋白具有TyrKc、FnⅢ等IR保守的结构域,含有117个丝氨酸磷酸化位点、51个苏氨酸磷酸化位点和16个酪氨酸磷酸化位点。EgIR蛋白的二级结构主要为无规卷曲,占41.06%;三维结构呈倒"V"型。EgIR在近膜区缺少NPXY基序,也不含有YxxxYY基序。EgIR与EmIR2和SjIR1的序列一致性分别为92.9%和35.1%,亲缘关系较近,与人、牛、羊IR的序列一致性分别为27.5%、27.2%和25.3%,亲缘关系较远。结论 EgIR蛋白有与EmIR2和SjIR1相似的功能,参与虫体葡萄糖代谢的调节及生长发育,可作为防治囊性包虫病的药物靶标。

• 单位
  基础医学院; 遂宁市中心医院; 重庆医科大学