基于网络药理学和分子对接的异喹啉生物碱肝毒性机制初探

作者：梁迪; 王辉; 谌立巍; 陈思敏^*

来源：中药与临床, 2022, 13(06): 44-69.

DOI：10.3969/j.issn.1674-926X.2022.06.010

• 异喹啉生物碱
• 肝毒性
• 网络药理学
• 分子对接

目的：通过网络药理学和分子对接技术探讨异喹啉生物碱（IAs）肝毒性（HT）的可能作用机制。方法：通过互联网科学数据库the web of science, PubMed, ScienceDirect, Geenmedical收集IAs的候选毒性化合物和靶点；从Genecards Database中获得HT相关靶点，并利用STRING数据库对IAs肝毒性的靶点基因进行分析；Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，CytoHubba插件筛选核心基因；通过Bioinformatics网站对IAs肝毒性的靶点基因进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。最后，使用Auto dock软件对核心毒性化合物和核心基因进行分子对接验证，并用pymol软件就对接结果进行3D可视化分析。结果：互联网科学数据库显示有13种IAs活性成分存在HT; PPI网络和核心靶点分析表明ANXA5、CASP3、CCL5、IL2和PPARG是HT的关键靶点。GO和KEGG分析显示，IAs可通过癌症途径、癌症中的蛋白多糖以及癌症中的微小RNA等通路参与过氧化氢的反应、凋亡过程的正调控等多种生物学过程。此外，分子对接方法证实了IAs的13种生物活性分子与HT靶点高度亲和，其结合活性可能受到化学结构中五碳环所处的位置，所连的基团，以及是否闭环有影响。结论：通过网络药理学和分子对接，从IAs的活性化合物可能通过作用于5个核心基因以及33条信号通路导致肝毒性。

• 单位
  成都中医药大学