三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析

作者：李学梅; 余育和; 解绶启; 颜庆云; 陈宇航; 董小林

来源：水生生物学报, 2011, (03): 423-429.

• 斑点叉尾
• 银鲫
• 异育银鲫
• PCR-DGGE
• 肠道微生物群落 Channel catfish
• Silver prussian carp
• Hybridized prussian carp
• Intestinal microbe

以室内饲养的斑点叉尾(Ictalurus punctatus)、银鲫和异育银鲫(中科三号)(Carassius auratus gibelio)幼鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术对其肠道微生物群落进行了探索研究。在三种鱼的肠道中检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带,其中斑点叉尾的平均谱带数(7.5)相对于银鲫和异育银鲫的谱带数(分别为15和14)要少。基于PCR-DGGE指纹谱带及各谱带相对丰度的UPGMA聚类和MDS排序结果显示银鲫和异育银鲫肠道微生物相似性高,而与斑点叉尾的差异比较大;rank-abundance散点图及回归分析也显示斑点叉尾与银鲫、异育银鲫肠道微生物群落存在...

• 单位
  中国科学院; 中国科学院研究生院; 淡水生态与生物技术国家重点实验室; 中国科学院水生生物研究所