弓形虫微线蛋白25的生物信息学分析及其互作蛋白预测

作者:孙慧; 王龙江; 李瑾; 徐超; 尹昆; 肖婷; 刘功振; 魏庆宽; 黄炳成*
来源:中国病原生物学杂志, 2020, 15(09): 1067-1070.
DOI:10.13350/j.cjpb.200914

摘要

目的对弓形虫微线蛋白25(TgMIC25)进行生物信息学分析,并预测其互作蛋白。方法利用ExPASY在线软件对TgMIC25蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构域、结构域、二/三级蛋白结构、蛋白磷酸化位点、互作蛋白进行预测分析;利用SYFPEITHI和IEDB预测其B/T细胞抗原表位,分析其免疫原性。结果 TgMIC25共编码302个氨基酸,相对分子质量为33.194×103,理论等电点为4.40。该蛋白无信号肽序列,在242-264 aa处存在一个潜在的跨膜区,主要是由EGF样结构域(Epidermal Growth Factor-like domain)组成,包含48个磷酸化位点,与TgMIC13为互作蛋白,具有多个B、T细胞抗原表位。结论生物信息学方法预测TgMIC25蛋白含有GEF样结构及个B、T细胞抗原表位,并与TgMIC13为互作蛋白,为该蛋白后续试验研究奠定基础。

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