烟草miRNA169基因家族及启动子的生物信息学分析

作者：蔡健宇; 贾蒙骜; 张孝廉; 余婧; 李勇; 雷波; 郭玉双^*

来源：烟草科技, 2019, 52(10): 1-12.

DOI：10.16135/j.issn1002-0861.2018.0518

• 烟草
• 基因家族
• miRNA169
• 生物信息学
• 低温胁迫
• 启动子

miRNA169是介导植物低温早花的关键因子。为了明确低温诱导烟草miRNA169基因家族表达的调控机制,培育耐低温抗早花的烟草新品种,对miRBase数据库中烟草miRNA169基因数据进行了分析,并对该基因家族及其启动子的结构和功能进行了预测。结果表明:在烟草基因组中共有19个miRNA169基因,分布在1号、8号和9号染色体上,同一染色体上的miRNA169分布集中。除pre-miRNA169t外,其他pre-miRNA169均具有很高的同源性。同时,在所有烟草miRNA169的启动子上均发现低温胁迫应答元件LTR,以及参与低温应答的激素脱落酸(ABA)和茉莉酸(JA)的应答元件。因此,推测烟草miRNA169对低温胁迫的响应过程可能是LTR、ABA和JA途径三者共同作用的结果。

• 单位
  贵州大学; 生命科学学院; 贵州省烟草科学研究院; 东北农业大学