摘要
为识别基因-药物共模块,更好地发现抗癌药物作用的分子机理,选择针对既定癌症的潜在药物靶标,在非负矩阵分解算法中加入基因、药物和基因-药物模块的数据信息,提出了SSJNMF算法。将该算法用于癌症药物敏感性基因组学数据集,识别了70个基因-药物共模块,与已发表的两种算法(NetNMF和JNMF)进行比较,结果表明,SSJNMF识别出的共模块具有更强的统计意义和生物意义。
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单位中车唐山机车车辆有限公司; 石家庄邮电职业技术学院; 燕山大学