牛肠道病毒北京株的分离鉴定及全基因组分析

作者：张姗; 李晓轩; 侯绍华; 鑫婷; 林湛椰; 袁万哲; 孙继国

来源：中国兽医科学, 2018, 48(07): 844-850.

DOI：10.16656/j.issn.1673-4696.2018.0142

• 牛肠道病毒
• 分离
• 基因组
• 比对分析

采用RT-PCR方法从北京某牛场有腹泻症状牛的粪便样品中检测到牛肠道病毒(bovine enterovirus,BEV),分离出1株病毒并将其命名为BJ101。然后,通过电镜观察、全基因组序列测定和同源性分析,对该毒株进行了验证。结果,BJ101分离株在MDBK细胞上的TCID50为1×10-6.42/0.1 m L,电镜观察到病毒颗粒直径为2530 nm,无囊膜,呈典型的小RNA病毒粒子形态;BJ101株的基因组长度为7 409 bp,其中5′非编码区(UTR)长812 bp,3′UTR长72 bp,病毒基因组开放阅读框(ORF)全长6 525 bp。对全基因组序列进行比对分析显示,在5′UTR区、编码区和3′UTR区,BJ101分离株与BEV E2型毒株的核苷酸相似性最高。基于VP1基因的系统进化树表明,BJ101株是BEV E2型的成员。上述结果丰富了国内牛肠道病毒的基因库,为BEV的诊断及预防奠定了良好的基础。

• 单位
  河北农业大学; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所; 农业部