小细胞肺癌潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测

作者：杨梦霞; 郭宵飞; 朱世杰; 芦殿荣; 王宁军^*

来源：河北医药, 2023, 45(02): 165-169.

• 小细胞肺癌
• 生物信息学
• 差异表达基因
• 关键基因
• 预后

目的 对小细胞肺癌发生发展的关键基因和分子机制进行生物信息学分析，为诊疗提供潜在靶点和生物标志物。方法 从GEO数据库筛选小细胞肺癌基因表达数据集，并运用GEO2R分析差异表达基因(DEG);再利用DAVID数据库对DEG进行富集分析，并构建蛋白互作网络图，进一步筛选出小细胞肺癌关键基因并进行预后分析。结果 筛选出614个DEG,其中上调基因328个、下调基因286个。富集结果显示，DEG的功能主要与微管运动、DNA修复、驱动蛋白复合物及微管结合等有关。根据蛋白互作网络中的节点连接度(Degree≥40),筛选出CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因。预后生存分析发现，关键基因高表达水平与不良预后有关(P均<0.01)。结论 CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因可能是小细胞肺癌诊疗的潜在靶点和预后标志物。

• 单位
  北京中医药大学; 中国中医科学院望京医院