基于网络药理学联合GEO数据库阐明复方乌梅散抗胃癌机制研究

作者：陈军

来源：中兽医医药杂志, 2021, 40(06): 23-2.

DOI：10.13823/j.cnki.jtcvm.2021.06.005

• 网络药理学
• 复方乌梅散
• 胃癌
• 靶点
• 通路

采用网络药理学方法探讨复方乌梅散治疗胃癌的作用机制。利用TCMSP数据库平台收集复方乌梅散中的活性成分及有效靶点,依托GEO数据库筛选胃癌相关靶点,获取药物活性成分靶点与胃癌靶点交集,获得交集靶点即为复方乌梅散作用于胃癌的预测靶点;使用Cytoscape 3.7.0软件的Biso Genet(3.0.0)插件构建化合物-交集靶点网络,利用Cytoscape插件CytoNCA对核心靶点进行拓扑分析,进一步构建核心网络;利用Bioconductor中的R包clusterprofiler version 3.12.0对药物与疾病交集靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路注释分析,并构建靶点-通路网络图。结果显示,共获得16个活性化合物,药物靶点172个,疾病靶点2 466个,交集靶点31个。PPI网络涉及79个蛋白质节点,关键靶点包括HSPB1、TP53、VCAM1、PARP1、CDK1。对交集靶点进行GO和KEGG通路富集分析结果显示,这些靶点富集在生物过程的条目有419个,其中388个与生物过程相关,9个与细胞组分有关,22个与分子功能有关。富集的KEGG通路有15条,涉及NF-κB信号通路、TNF信号通路、p53信号通路等多种与胃癌相关的通路。以复方乌梅散抗胃癌靶点-通路网络图揭示复方乌梅散靶点与疾病通路之间的互作关系。本研究筛选了复方乌梅散治疗胃癌的关键靶点和通路,为复方乌梅散用于临床治疗提供了科学依据。

• 单位
  兰州大学第二医院