中国汉族人群肺结核易感HLA基因型荟萃分析

作者：吕钰冰; 林国旺; 何鹏; 林丽娟; 方艳平; 江凌晓

来源：分子诊断与治疗杂志, 2022, 14(12): 2154-2158.

DOI：10.3969/j.issn.1674-6929.2022.12.032

• 肺结核
• 遗传易感性
• HLA基因
• 麻风病

目的 研究汉族人群肺结核的易感HLA基因型,并精确定位易感HLA基因编码的关键氨基酸位点.方法 本研究基于公开的北方汉族人SNP芯片数据开展基因型插补(imputation),获得967例肺结核病例和7034例对照样本的MHC区间变异位点及经典HLA等位基因型信息;利用逻辑回归模型分析遗传变异与肺结核的关联性;基于本研究及上海地区发表的肺结核关联分析结果(含833个肺结核病例和1220个对照)开展荟萃分析以明确汉族人群肺结核风险HLA等位基因型,并精准定位易感基因的关键氨基酸位点.结果 HLA区间肺结核SNP荟萃分析结果显示HLA-B区间存在两个显著位点rs112974895(OR=1.35;P=6.44×10-7)、rs9266067(OR=1.34;P=1.31×10-6).肺结核HLA基因型荟萃分析发现共有4个HLA等位基因型与肺结核显著关联,HLA-B*46:01关联性最为显著(OR=1.44;P=2.98×10-7),其余3个显著关联的基因分别为HLA-DQA1*01:03(OR=1.28;P=1.36×10-4)、HLA-DQA1*01:04(OR=1.37;P=2.63×10-4)、HLA-DQB1*06:01(OR=1.31;P=5.32×10-5),其中HLA-B首次被报道为汉族人肺结核风险基因.精细定位分析发现,HLA-B基因的第66-69-76位氨基酸构成的单倍型Lys66-Arg69-Val76与肺结核发病密切关联(OR=1.53,P=1.92×10-5),是易感基因的关键氨基酸位点.HLA-B*46:01与麻风病发病密切相关(OR=0.33,P=1.13×10-10),但其作用与肺结核的相反,是麻风病的保护因素.结论 本研究证明HLA-B*46:01是汉族人的肺结核易感基因型,同时发现该基因型在麻风病中起保护作用,为疾病的精准防治提供新的参考依据.