生鲜畜禽肉中沙门氏菌全基因组分析与分子溯源

作者：宋晟; 高晗^*; 严礼; 郭焜鹏; 张海韵; 王芳斌

来源：食品与机械, 2020, 36(09): 55-169.

DOI：10.13652/j.issn.1003-5788.2020.09.009

• 沙门氏菌
• 全基因组测序
• 系统进化树
• 分子溯源研究

依据GB 4789.4—2016对从长沙市生鲜市场随机采集的生鲜猪肉、鸡肉进行检验。结果显示:有20份生鲜猪肉样品检出沙门氏菌,检出率为83.3%;有20份生鲜鸡肉样品检出沙门氏菌,检出率为74.1%;总检出率为78.4%。通过对其中40株沙门氏菌进行全基因组测序与分子溯源研究,结果表明:20株猪源性沙门氏菌与20株鸡源性沙门氏菌按分子溯源分析可分为5个明显不同的聚类,清晰反映了沙门氏菌的污染源分布及交叉污染情况,实现了精准溯源;其中发现了15个致病基因,从基因层面阐明了沙门氏菌可能存在的致病基因与致病机制,提示了沙门氏菌潜在的致病风险;试验发现了15个耐药基因,从基因层面阐明了沙门氏菌可能存在的耐药基因与耐药机制。

• 单位
  湖南省食品质量监督检验研究院